| Site ressource |
Commentaire |
| Alfabet |
Alfabet (A machine-Learning derived, Fast, Accurate Bond dissociation Enthalpy Tool) est un outil permettant le calcul des énergies de dissociation de liaison au moyen de différentes méthodes (DFT par exemple). La molécule choisie peut être identifiée avec le système SMILE, soit dessinée sur une interface graphique. |
| Avogadro |
Un logiciel de simulation simple d'emploi, basé sur l'importation de fichiers spécifiques à la chimie (PBD, SMILES...). Il offre de nombreux outils d'édition et une bonne qualité d'image.
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| ChemSketch |
Un logiciel de dessin, en version gratuite (limitée) ou payante (complète). Le logiciel permet de dessiner des structures organiques et des polymèress, calculer des propriétés (masse, densité, réfractivité molaire...)., il inclut une prévisualisation 3D. |
| d-d Spectr. Calc. |
Calcul des transitions d-d des complexes D4h et Oh (nombre d'électrons paramétrable). Visualisation des termes spectroscopiques autorisées de spin. Deux modes : calcul des transitions, visualisation des spectres. |
| EpH-Web |
Tracé de diagrammes de Pourbaix paramétrables (gammes de température, molalité, pH et potentiel). |
| Geogebra |
Outil en ligne permettant de tracer des courbes avec des paramètres et les faire varier. |
| Hemoglobine |
Animation géante de l’hémoglobine. Possibilité de visualiser l’hème sous différentes configurations ainsi que les mouvements de grande échelle participant à son allostérie. |
| HuLiS |
Un logiciel de calcul de type Hückel et valence bond basé sur java par les enseignants de l'université de Marseille. L'interface graphique rend la prise en main rapide, le logiciel est très simple d'utilisation et très intuitif. Très pratique pour obtenir rapidement les OM de systèmes insaturés. |
| JMol |
Logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D, développé en Java et multi-plateformes (Windows, Mac OS X, Linux, systèmes Unix). |
| LatticeEnergy |
Outils en ligne pour calculer les énergies de réseaux en suivant les modes de calculs semi-empiriques standard (Born-Landé, Born Mayer) en rentrant un paramètre de réseau, une charge par ion et un rayon par ion sur des composés AB. |
| LibMol |
Un logiciel éducatif libre, conçu pour l'enseignement de la biologie structurale, disponible sous la forme d'une application en ligne (accessible à partir d'un navigateur sans installation, toujours actualisée) ou d'un logiciel téléchargeable installable en local. Utile pour visualiser les molécules d'intérêt biologique.
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| Mecanismose |
Animations en organométallique, transferts d’électron ou de protons basé sur JSmol. |
| Mercury |
Un logiciel libre à télécharger pour la visualisation les structures cristallographiques du (CCDC) Cambridge (Linux, Windows et Mac). |
| MolView |
Une application en ligne, facile d'utilisation. Elle peut servir d'éditeur de structures et d'outil de visualisation 3D. Importation possible de molécules issues de bases de données (PubChem, RCSB Protein Data Bank et Crystallography). Exportation de figures 2D ou 3D au format .png. |
| NMRDB |
Simulation de spectres H (1D et 2D) et 13C très simple d'emploi (dessin de la molécule). |
| NMRshiftDB |
Analyses et simulations de spectre RMN 1H et 13C et de 9 autres noyaux (N, F, P,...). Très simple d'emploi. |
| OPSIN |
Génération d'une structure moléculaire à partir du nom IUPAC de la molécule. Javascript téléchargeable pour un usage local. |
| Orbimol |
Calcul (Gaussian) et visualisation des orbitales atomiques et orbitales moléculaires de 938 molécules (énergie, orbitales frontalières...). |
| Orbitron |
Visualisation des orbitales atomiques et de quelques orbitales moléculaires (nécessite Flash Macromedia). |
| Orca |
Un logiciel multiplateformes pour le calcul quantique développé par FAccTs (Institut Max Planck). Il permet d'effectuer localement des simulations relatives aux propriétés des molécules (géométrie, fréquences de vibrations, thermodynamique, solvatation...), la réactivité (états de transition, barrières d'énergie, effets isotopiques, fonctions de Fukui), la spectroscopie (IR et Raman, UV-visible, RMN, RPE, dichroïsmee circulaire) et les méthodes multiéchelles. |
| PubChem |
À partir d'un identifiant (formule, dessin, CAS RN, SMILE...) cette application permet d'obtenir n'importe quel autre identifiant : CAS RN, nom IUPAC, ChemSpider ID, Masse molaire, Image gif, Formule moléculaire, InChIKey, InChI, SMILES, FICTS, FICuS... Affiche de plus des données physico-chimiques, toxicologiques et bibliographiques sur l'espèce recherchée. |
| Vesta |
Programme de visualisation 3D pour les structures chimiques, données volumétriques telles que la densité électronique, et les morphologies cristallines. Pas très évident à utiliser au premier abord, il s’avère très utile une fois maîtrisé (30 formats de fichier utilisables). |
| VLE-Calc |
Diagrammes d'équilibre liquide-vapeur (binaires et ternaires) isobares et isothermes paramétrables (choix des composants et du type de diagramme). |
